Ces appels à projets (Flagships) ont pour objectif de soutenir la construction et le déploiement des premières usines de ce type en Europe (« First-of-its-kind »), visant un niveau de maturité technologique élevé (TRL 8). Ils doivent permettre de valider des modèles économiques durables à grande échelle pour la bioéconomie. Ces travaux seront portés par des consortiums industriels ambitieux souhaitant implanter une capacité de production commerciale innovante.

Les projets devront s’inscrire dans l’une des thématiques prioritaires suivantes :
- Booster la compétitivité des bioraffineries grâce aux biotechnologies.
- Alternatives biosourcées (SSbD) pour les produits fertilisants et/ou la protection des cultures.
- Solutions biosourcées (SSbD) pour les soins à domicile et/ou les soins personnels.
- Diversification des sources d’ingrédients alimentaires nutritionnels pour une résilience accrue de l’UE et une autonomie stratégique.
Ce dispositif s’adresse à des consortiums constitués d’au moins 3 entités légales indépendantes établies dans 3 pays différents (dont au moins un État membre). Le financement couvre 60% des coûts pour les entreprises privées (100% pour les organismes à but non lucratif), pour des projets de grande envergure d’une durée estimée entre 4 et 5 ans disposant d’un budget indicatif de 20 millions d’euros. Une contribution en nature (IKOP) représentant 20% des coûts éligibles totaux est exigée de la part du consortium.